生物化学指标检测
生物化学指标是指通过对水样中的某些化合物或酶活性进行测定，以评估水体生态环境质量的一种方法。常用的生物化学指标包括溶解有机物（BOD5）、总磷、总氮、挥发性有机化合物（VOCs）等。这些指标能够反映水体污染程度和生态系统健康状况。
物理参数监测
物理参数监测主要包括温度、pH值、电导率和悬浮固体量等。在自然条件下，水温和pH值会影响微生物活动，对于许多 aquatic organism 是生活必需的因素。电导率则可以用来判断溶解盐分浓度，而悬浮固体量则反映了在水中是否存在大量的泥沙或其他颗粒状物质。
化学分析法
化学分析法是通过各种仪器设备直接对水样中的元素或化合物进行分析，来确定其含量的一种方法。这通常涉及到如离子色谱、高效液相色谱以及原子吸收光谱等现代分析技术。这些仪器能快速准确地检测出多种重金属、农药残留以及其他可能对人畜健康构成威胁的有害物质。
微生物生态学研究
微生物生态学研究着眼于流域内微生物群落结构及其功能在维持良好饮用水质量方面所扮演的角色。例如，对于细菌群落特征进行分类识别，可以帮助了解污染源分布；而对于真菌群落观察，可提供关于土壤养分循环状态信息。此外，还可通过探究藻类繁殖情况以预警湖泊/河流遭受过度营养负荷导致的大面积藻华事件。
多元模型综合评价
随着数据处理能力和计算机软件技术的发展，越来越多采用多元模型综合评价来评估整个流域环境状况。这意味着将不同类型（如物理、化学、生物）的数据整合起来形成一个全面的评估体系，从而更全面地理解各个层面上的问题，并制定有效治理措施。此外，这一方法还能根据不同的管理目标，如保护饮用水源还是促进渔业开发，调整评价标准，以适应不同需求的情况下作出决策。
