pH值
水质检测仪中最基本的指标之一是pH值，它代表了水体中的酸碱性。pH计测量的是溶液中氢离子浓度与对应的hydrogenion浓度之比。在自然界中，许多生物都有适宜的pH范围，只有在这个范围内，生物才能够正常生存和繁殖。例如鱼类通常生活在pH为6.5至9.0之间，而人类则更喜欢生活在稍微偏酸性的环境下，大约为7到8之间。但如果水体的pH过高或过低，都可能对生态系统造成严重破坏。因此，在进行水质检测时，对于pH值的控制非常重要。
氧气含量
氧气含量是衡量淡水是否富氧化程度的一个重要参数。如果一个地区的地表水氧气含量不足，会导致鱼类缺氧而死亡，同时也会影响其他 aquatic life 的生存。此外，如果长时间处于缺氧状态，还可能导致地下水层受污染，因为没有足够的氧气来帮助分解这些污染物。因此，对于维护良好的饮用水质量来说，保持合理水平的 dissolved oxygen 是必要条件。
总磷和总氮
总磷和总氮是评价湖泊、河流等淡 水体所受排放压力的重要指标，它们可以反映出农业废弃物、工业废料及城市生活垃圾排放的情况。这两种元素在自然环境中的循环过程对于支持植被生长至关重要，但过多的人为排放会引起“eutrophication”（营养盆地化），进而导致藻 bloom 和底栖植物大量增殖，从而减少光照强度，有害生物滋生的可能性增加，这些都会对整个生态系统产生负面影响。
重金属含量
重金属如铅、汞、镉等因其毒性而受到特别关注，因为它们具有高度积累效应，即一旦进入环境，就难以完全去除，而且易与食物链中的每个层级发生相互作用，最终通过食物链进入人体，对健康构成潜在威胁。在进行监测时，不仅要考虑单一金属元素，还要注意它们之间相互作用以及与其他污染物（如有机污染物）的协同效应，以确保能够全面评估潜在风险并采取有效措施来控制其释放。
微生物群落结构分析
微生物群落结构分析涉及到对各种细菌、 archaea 和古菌等微小生命形态及其分布情况的一系列考察。这项测试能提供关于当地土壤或沉积物状况，以及潜在地向地下层扩散的问题信息。例如，在某些情况下，如发生泄漏事件或者未妥善处理废弃化学品，那么这些敏感的小型生命形式就可以成为评估区域是否受到污染的一个可靠指示器。此外，这些微生物还能作为环境变化趋势和历史记录的一部分，为科学家提供宝贵资料用于研究地球史上的重大事件。
